L’objectif principal du laboratoire est d’obtenir une compréhension extrêmement détaillée de microorganismes modèles qui permettrait ensuite, en développant de nouvelles méthodes d’ingénierie génomique, de les programmer pour accomplir diverses tâches. Les retombées potentielles de cette approche sont nombreuses, tant du point de vue de l’avancement des connaissances fondamentales que des applications possibles en médecine, décontamination environnementale, production d’énergies propres, etc. Plusieurs experts estiment que la biologie synthétique pourra répondre à de nombreux défis critiques auxquels l’humanité fait présentement face et ainsi profondément transformer le XXIe siècle.
Au laboratoire, nous nous concentrons principalement sur deux organismes modèles: Mesoplasma florum, une bactérie quasi-minimale de la classe des Mollicutes, et Escherichia coli, l’une des bactéries les plus étudiées à ce jour. Nous sommes également intéressés à mieux comprendre la biologie de certains éléments génétiques mobiles tels que les plasmides conjugatifs puisque ceux-ci représentent des substrats particulièrement puissants pour des applications en biologie synthétique. Voici quelques exemples de projets menés au laboratoire:
- Characterization intégrative à l’échelle du génome de la bactérie M. florum
- Développement d’outils de modification génétique pour M. florum
- Recodage et reprogrammation du génome de M. florum
- Développement d’approches de modélisation pour la biologie des systèmes et la biologie synthétique
- Développement de plateformes robotiques open-source pour les opérations de routine en biologie
- Étude des plasmides conjugatifs et de leurs rôles dans la dissémination de la résistance aux antibiotiques
- Ingénierie de plasmides conjugatifs pour des applications thérapeutiques
- Étude du phénomène de létalité synthétique chez E. coli
